靈山寺位於小琉球嶼北方沿岸山崖，白沙尾碼頭左側，當東港或中芸前往琉球之交通船駛近該嶼時，首先映入眼簾者，即此古色古香富麗莊嚴之寺觀，該寺係於民國四十九年六月間，由陳乃等士紳募資所興建，並蒙台灣省警備總部琉球職訓三總隊、海軍實踐隊鼎力協助，歷經三年，於五十二年始告完成。

如果說烏鬼洞看海，山豬溝看山，那麼,美人洞,就是個包山包海的小琉球景點

位於南投縣鹿谷鄉的溪頭自然教育園區(溪頭森林遊樂區)，屬臺大實驗林溪頭營林區

位在小琉球的最西側，是一處欣賞落日的最佳地點

「白沙尾觀光港」乃遊客往返東港與小琉球之主要港口

小琉球一處的厚石群礁，有著一望無際的藍。猶如明信片般的美不勝收，還有老鼠石、觀音石、紅番石。

　花瓶石為小琉球島上最著名的景點，其形成原因是原本的海岸珊瑚礁被地殼隆起作用所抬升，然後頸部受到長期的海水侵蝕作用，因此形成上粗下細，類似花瓶的特殊造型。 　　本景點由於鄰近小琉球主要的出入港口－白沙港，因此常成為第一個旅客造訪的琉球嶼景點，有許多遊客在此觀景與戲水，但是過度接近有可能會降低花瓶石的景觀品質。 　　在花瓶石周圍，還可以看見目前正在海水面下新形成的珊瑚裙礁，也是琉球嶼還正受到地殼隆起作用的證據之一。

位於小琉球東北側，介於龍蝦洞至白沙新港間的沙灘即為「中澳沙灘」

小琉球管理站暨遊客中心座落於白沙觀光港旁的半山腰上，是一棟三層樓的建物。